Quería saber si es malo tener relaciones con condón y utilizando metronidazol

No, no es malo.

Realmemte no existe ninguna relación entre el uso del metronidazol y el uso del preservativo. Tienes que usar siempre preservativo sin importar los medicamentos que tu uses, o que use la otra persona.

Espero haberte ayudado y estaré atento si tienes más dudas para poder orientarte.