Me tome la pastilla de emergencia a las 1 hira de haber tenido relaciones y a las 2 horas me dio tos y saque una flema esto afecta el efecto de la pastilla

No, no afecta la efectividad del medicamento.

La pastilla de emergencia tiene una absorción a nivel del estomago, después de haberle tomado la pastilla NO va a salir del estómago en forma de flema, ni se va a perder su efectividad.

Es posible que la flema sea causado por alguna otra condicion, y NO por la pastilla.

Sin embargo te recomiendo tener un método de planificación confiable para evitar esta clase de preocupaciones.

Espero haberte ayudado y estaré atento si tienes más dudas para poder orientarte.