Tengo 3 días de retraso pero un flujo marrón podría considerarlo una mestruacion cuales serían las causas

Dependiendo de la cantidad del flujo y de su duración, podría considerar como tu sangrado menstrual y las características del mismo pueden deberse a:

• Desequilibrios hormonales.
• Pólipos.
• Miomas uterinos.
• Ejercicio intenso.
• Obesidad o delgadez extrema.
• Anticonceptivos hormonales.
• Estrés y ansiedad. 
• Procesos infecciosos. 

Si durante tu siguiente ciclo, se vuelve a presentar de la misma forma, te recomiendo acudir a una valoracion médica, para realizar los estudios pertinentes, determinar la causa e instaurar el manejo apropiado.

Espero haber aclarado tu duda, ante cualquier nueva inquietud, estaremos atentos. No olvides calificarnos.