Llevo mi segundo óvulo vaginal y lo puse en la noche y en la mañana tuve relaciones con condon interfiere en mi tratamiento?? Es clindamicina con ketoconazol

No, las relaciones sexuales con protección no interfieren en tu tratamiento. sin embargo, es recomendable abstenerte de tener relaciones mientras la infección vaginal se solventa. El ardor que presentas durante la penetración, muy probablemente sea debido a la infección vaginal que presentas. Como medidas generales adicionales te recomiendo:

• Lavar y secar apropiadamente el área genital. 
• No usar ropa interior ni pantalones ajustados.
• Usar ropa interior preferiblemente de algodón.
• No usar lociones intimas.
• No usar duchas vaginales ni tampones. 
• Asearte apropiadamente posterior a cada relación sexual.

Si posterior a culminar tu tratamiento, las molestias persisten, debes acudir nuevamente a una valoración médica.

Espero haber aclarado tu duda, ante cualquier nueva inquietud, estaremos atentos. No olvides calificarnos.