Cuando tengo relaciones anales me duele el vientre, pero solo tuve flujo color marrón dos días. Y no tengo ninguna otra molestia

Esto puede estar ocurriendo como consecuencia de la ubicación del ano con relación al resto de las estructuras de la pelvis.Puedes tomar un antiinflamatorio, si aún así el dolor persiste debes consultar con un médico. El manchado puede ser tu menstruación que está por llegar, si aún no es tiempo y dura mas de 5 días seria oportuno que consultes para evaluar la irregularidad de tu ciclo.