Cuando tomo agua y pasa tiempo sin que coma algo, siento un mal sabor en la boca e incluso un aliento no tan agradable. ¿Es normal?

Es completamente normal que en largos periodos de tiempo donde no ha tenido ingesta de alimentos, existan bacterias en la boca que puedan causar mal aliento. Le recomiendo cepillarse muy bien los dientes.
Por otro lado, el mal sabor -especialmente si lo identifica como un sabor metálico en la boca y sensación de quemazón- puede indicar presencia de reflujo gastroesofágico.