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No, las infecciones no deberían alterar el periodo menstrual como tal. Algunas infecciones vaginales pudieran ocasionar que exista mal olor durante la menstruación, o que sea molesto o doloroso este periodo por contacto entre la zona irritada con las toallas sanitarias o tampones, sin embargo, no debería alterarse la ciclicidad (cada cuanto se presenta), cantidad o duración. La razón por la cual puede existir mal olor, es que las bacterias interaccionan con la sangre, y el cambio de pH que se produce aumenta la producción de sustancias como aminas, que pueden liberar "olor a pescado" por ejemplo. Además en su mayoría, estas lesiones producen enrojecimiento e inflamación, que empeora con al humedad aumentada y el roce con los elementos de higiene, con toallas y tampones.
Algunos medicamentos usados en el tratamiento de las infecciones vaginales, por ejemplo el clotrimazol, pudieran ocasionar sangrados locales, que pudieran confundirse con menstruación, pero no lo son.
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