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Al iniciar las pastillas en los primeros 5 días del ciclo menstrual (en tu caso en el segundo) estabas protegida desde el primer día, por lo tanto estabas doblemente protegida al usar preservativo, puede ser normal presentar este manchado o sangrado, esto es porque las pastilla anticonceptivas son anticonceptivos hormonales por lo tanto puedes presentar cambios en la menstruación, algunas mujeres notan que su sangrado va disminuyendo al punto de solo tener manchados, otras notan solo que su sangrado es mas leve, otras presentan sangrados entre menstruaciones, algunas presentan sangrados abundantes y un porcentaje de mujeres tienen ausencia de la menstruación.
Normalmente estos efectos manchados mejoran o desaparecen en los siguientes ciclo, sin embargo si esto no sucede entonces se debe valorar un cambio de hormonas o de dosis.
Si tienes más dudas es necesario que vuelvas a formular otra pregunta, estaré al pendiente de tus dudas. Recuerda manita arriba si te sirvió y si no te sirvió te pido que nos comentes el porque para poder mejorar.