¿A qué se puede deber el tener comezón en los brazos y en las piernas al momento de acostarme? 

Hay algo llamado Escabiosis que se suele comportar de esa forma, produce un prurito intenso especialmente de noche y se asocia con ropa de cama y/o colchones contaminados por ácaros, en ese orden de ideas se descartaría esa condición clínica primero y luego se buscaría ver si es o no causada por otros agentes.