tengo 2 semanas de gestación pero porque estoy manchando con color marrón?.

No es normal que estés sangrando en estado de gestación, esto puede generarse por múltiples causas como amenaza de aborto, embarazo ectópico, sangrado de implantación, traumas, etc, en ese caso te recomiendo acudir al servicio de urgencias más cercano para realizar estudios necesarios, recibir manejo e indicaciones médicas y evitar riesgos en el embarazo.

Espero haberte orientado.