Efectivamente podría tratarse de una enfermedad de transmisión sexual que podrían estar relacionadas con herpes en lo que se denomina como una faringitis herpética. Sin embargo, es lógico pensar en otras causas virales o bacteriana de faringitis como causa por lo que tu médico probablemente ha indicado la Amoxicilina + acetilcisteína (Cistefort Duo®). Lo indicado en este caso es cumplir el tratamiento como lo ha indicado tu médica y en caso de persistencia de los síntomas acudir a valoración para replantear el diagnóstico y dar el manejo adecuado. De igual manera, debes estar atentas a lesiones alrededor de la boca o a nivel genital que podrían orientar el diagnóstico.

Espero haber resultado útil.