Tengo quistes en mis ovarios y planifico con la inyección mensual ¿puedo tener problemas más adelante o quedar embarazada?

No, no hay problema que uses este método, incluso podrían mejorar con el efecto del anticonceptivo. El hecho que tengas esos quistes no te pone en mayor riesgo de embarazo, pero si observas que tienes mucho acné, sobrepeso u obesidad, aumento del vello corporal debes asistir a cita con tu medico tratante para definir si requieres seguimiento por ginecologia.