Tomé Albendazol de 200 mg después del almuerzo, pero me dio náuseas. Me arde el estómago en la noche. ¿Puedo tomar Omeprazol?

Lo más probable es que las náuseas y gastritis que está sintiendo sean efectos adversos del uso del Albendazol. Son síntomas transitorios y deben disminuir con el paso de las horas.
Puede tomar un Omeprazol si lo desea y si tiene síntomas, pero no es necesario continuar el medicamento por más días.