Cada mañana me despierto con muchos mocos y también en la boca, ya van como 3 semanas así y a veces siento como si no pudiera respirar bien por la nariz. ¿Qué podría ser?

Lo más probable es que sea rinitis alérgica. Durante la noche y debido al contacto con diferentes alergenos, se aumenta la producción de moco o se disminuye su barrido y por lo tanto se hace más molesto al levantarse.
Esto es debido a múltiples factores como el polen, el polvo, contaminación, contacto con animales o cualquier alergeno del ambiente.