¿Un problema en el metabolismo puede ocasionar cambios en la orina por la forma como se están metabolizando los alimentos?  

En algunos casos si, pero esos cambios se reflejan más en el color de la orina que en su cantidad o volumen, así que efectivamente, algunos problemas metabólicos pueden causar cambios en la orina especialmente en su color. Por lo general son enfermedades genéticas del metabolismo.