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Sí llegó tu periodo después de haber tenido relaciones sexuales, la probabilidad que estés en embarazo sería baja, sin embargo dados los síntomas que tienes y dado que hay dudas sobre si el eyaculó cerca de tu vagina,te sugiero realizar una prueba de embarazo en orina. La cual puedes comprar en tu droguería más cercana. En caso que salga positiva, debes confirmar el resultado con una prueba en sangre.
Para evitar sustos como el que tienes te recomiendo utilizar preservativo y así tener relaciones sexuales sin que tengas que preocuparte por esto.
Espero haber resuelto tu inquietud, cualquier otra duda estaremos atentos.