¿Puede ser una alergia lo que tiene mi bebé si tose mucho, estornuda seguido y está disfónica desde hace dos semanas? 

Lo más recomendable es que se consulte al médico tratante para que se haga una historia clínica completa y un examen físico para poder guiar el diagnóstico y así mismo el tratamiento. En ocasiones sí puede relacionarse con alergias tempranas, pero lo mejor es siempre consultar al pediatra.