¿A qué se debe el tener siempre la mala costumbre de defecar al levantarme en la mañana? 

No es para nada una mala costumbre, se diría que es un comportamiento completamente normal del sistema digestivo, en parte, esto se debe a un reflejo gastrointestinal normal que se produce en las primeras horas de la mañana y en parte a que el organismo ya se acostumbró u habituó a tener deposiciones en ese momento.