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Sí, debes contarlo como tu ciclo, PERO, si planificas haciendo uso del ciclo menstrual, debes saber que por ahora no va a ser confiable este método, dado que la pastilla de emergencia puede generar alteraciones en la menstruación varios meses posterior a su toma, de manera que será recomendable, que si no quieres quedar en embarazo uses el condón o evalúes usar otro método anticonceptivo de uso regular para evitar el embarazo.
Espero haberte orientado.